Σύμφωνα με το άρθρο 24 του Νόμου 2939/2001, αρμόδιος φορέας για το σχεδιασμό και την εφαρμογή της πολιτικής για την εναλλακτική διαχείριση των συσκευασιών και των «άλλων προϊόντων» είναι το μη κερδοσκοπικού χαρακτήρα Νομικό Πρόσωπο Ιδιωτικού Δικαίου (Ν.Π.Ι.Δ) με την επωνυμία «Εθνικός Οργανισμός Εναλλακτικής Διαχείρισης Συσκευασιών και Άλλων Προϊόντων» και το διακριτικό τίτλο "Ε.Ο.Ε.Δ.Σ.Α.Π.".

Με το Προεδρικό Διάταγμα υπ’ αριθμ. 99 (ΦΕΚ 154 Α 31-07-2008) καθορίζονται τα σχετικά με τη συγκρότηση, τη διάρθρωση και τη λειτουργία του Ε.Ο.Ε.Δ.Σ.Α.Π. καθώς και ο Κανονισμός Οικονομικής διαχείρισης και προμηθειών του Οργανισμού, ενώ με το Προεδρικό Διάταγμα υπ’ αριθμ. 170 (ΦΕΚ 228 Α 7-11-2008) εγκρίθηκε ο «Οργανισμός υπηρεσιών και προσωπικού του Ε.Ο.Ε.Δ.Σ.Α.Π.».
Με την υπ.αριθμ. οικ.119286/15-4-09 Απόφαση του Υπουργού ΠΕΧΩΔΕ συγκροτήθηκε το Διοικητικό Συμβούλιο του Ε.Ο.Ε.Δ.Σ.Α.Π.

Μέχρι την έναρξη λειτουργίας του Ε.Ο.Ε.Δ.Σ.Α.Π. οι αρμοδιότητές του ασκούνται από το Γραφείο Εναλλακτικής Διαχείρισης Συσκευασιών και Άλλων Προϊόντων (Γ.Ε.Δ.Σ.Α.Π) που υπάγεται στη Δ/νση Περιβαλλοντικού Σχεδιασμού της Γενικής Διεύθυνσης Περιβάλλοντος του ΥΠΕΚΑ (άρθρο 24 παρ. 11.1).

Μετά την έναρξη της λειτουργίας του Ε.Ο.Ε.Δ.Σ.Α.Π. το Γ.Ε.Δ.Σ.Α.Π εξακολουθεί υφιστάμενο με αρμοδιότητα τον έλεγχο και την εποπτεία του έργου του Ε.Ο.Ε.Δ.Σ.Α.Π.